প্রধানত প্রাকৃতিক কারণে পুরোনো ব্রহ্মপুত্র মরে যাচ্ছে। ১৭৬২, ১৮৮৫ ও ১৮৯৭ সালে তিনটি শক্তিশালী ভূমিকম্পের ফলে ব্রহ্মপুত্র তার গতিপথ পরিবর্তন করেছে। যমুনাকে প্রধান ধারা বানিয়েছে। জামালপুরে যেখানে বর্তমান পুরোনো ব্রহ্মপুত্র ও যমুনার সংযোগস্থল, সেখানে বড় ধরনের চর পড়েছে। ফলে কালক্রমে ভাটিতে ব্রহ্মপুত্র ক্রমেই সংকুচিত হয়েছে। এর সঙ্গে যোগ হয়েছে বেপরোয়া নদী দখল ও বালু উত্তোলন। এ ছাড়া বিলার ব্রিজ নির্মাণও ব্রহ্মপুত্র সংকুচিত হওয়ার অন্যতম কারণ।