মুহম্মদ মহিউদ্দিন ফারুকী ২০০৩ সালের ১০ ডিসেম্বর বাংলাদেশ পুলিশে যোগদান করেন। সর্বশেষ তিনি র‍্যাব-১২ এর অতিরিক্ত পুলিশ সুপার (এএসপি) এর দায়িত্বে ছিলেন।