বাজারের বেশিরভাগ বিস্কুটের গায়ে ছোট ছোট ছিদ্র থাকে। বেশকিছু বিস্কুটে ছিদ্র করা হয় দেখতে আকর্ষণীয় হবে বলে। তবে এটাই একমাত্র কারণ নয়। বিস্কুটের গায়ে ছিদ্র থাকার পিছনে রয়েছে বৈজ্ঞানিক যুক্তিও।
অধিকাংশ বিস্কুট তৈরি করতে ময়দার সঙ্গে চিনি ও লবণের মতো উপাদান মিশিয়ে মণ্ড তৈরি করা হয়। তারপর সেগুলোকে পাতলা করে গড়ে থালার মতো পাত্রে পরপর সাজিয়ে বেক করতে দেওয়া হয়। এই বেক করতে গেলেই অনেক সময়ে মণ্ড ফুলে ওঠা ও তার ভিতরে বাতাসের বুদবুদ তৈরি হওয়ার মতো বিড়ম্বনা দেখা দিতে পারে। এই ধরনের বুদবুদ বিস্কুটের গঠন নষ্ট করে। ভঙ্গুরও করতে পারে ক্ষেত্র বিশেষে। এই বিড়ম্বনা এড়াতেই বিস্কুটের গায়ে ছোট ছিদ্র করে দেওয়া হয়। এতে বেক করার সময়ে সহজে বাতাস চলাচল করতে পারে ভেতর দিয়ে।
কিছু ক্ষেত্রে অবশ্য বিস্কুট তৈরির উপকরণের তারতম্য থাকায় ছিদ্রের প্রয়োজন হয় না। ময়দার পরিমাণ কতটা বা কতক্ষণ বেক করার প্রয়োজন হচ্ছে, তার উপর নির্ভর করে বিস্কুটে ছিদ্র থাকবে কিনা।