একজন মন্ত্রী নির্বাচিত সরকারের নীতির প্রতিনিধিত্ব করেন, সংসদের কাছে জবাবদিহি করেন এবং নির্বাচনী অঙ্গীকার বাস্তবায়নের রাজনৈতিক দায়িত্ব পালন করেন। অতএব, স্বাস্থ্য মন্ত্রণালয়ের নেতৃত্ব রাজনৈতিক হওয়া গণতন্ত্রের স্বাভাবিক প্রক্রিয়া। কিন্তু এখানেই একটি মৌলিক নীতিগত সীমারেখা টানা অপরিহার্য। রাজনৈতিক নেতৃত্ব বনাম প্রশাসনিক নিরপেক্ষতা। মন্ত্রী রাজনৈতিক হতে পারেন, কিন্তু প্রশাসন রাজনৈতিক হতে পারে না।
স্বাস্থ্য সচিব, মহাপরিচালক (ডিজিএইচএস), হাসপাতাল পরিচালক, নিয়ন্ত্রক সংস্থার প্রধান, মেডিকেল বিশ্ববিদ্যালয়ের উপাচার্য বা প্রো-ভিসি—এসব পদ মূলত পেশাভিত্তিক। অতীতে এসব পদে সক্রিয় দলীয় রাজনীতিতে যুক্ত বা দলীয় পদধারী ব্যক্তিকে নিয়োগ দেয়ায় প্রতিষ্ঠানগুলো রাজনৈতিক মেরুকরণের শিকার হয়েছে।