সচিব ও অন্যান্য গুরুত্বপূর্ণ কর্মকর্তা নিয়োগে নির্বাচন কমিশন সচিবালয়কে স্বাধীনতা দেওয়ার প্রস্তাবটির সঙ্গে মন্ত্রিপরিষদ বিভাগ একমত হয়নি। নির্বাচন বিশেষজ্ঞদের মতে, এর ফলে নির্বাচন ব্যবস্থা সংস্কার কমিশনের অন্যতম গুরুত্বপূর্ণ একটি সংস্কার প্রস্তাব আলো মুখ দেখবে না।
তারা মনে করেন, আসন্ন জাতীয় নির্বাচনের আগে নির্বাচন কমিশনের স্বায়ত্তশাসন জোরদার ও কার্যক্রমকে সুষ্ঠুভাবে পরিচালনার জন্য অন্তর্বর্তী সরকারের প্রচেষ্টাকে দুর্বল করছে এমন সিদ্ধান্ত।
সম্প্রতি আইন মন্ত্রণালয়ের মাধ্যমে মন্ত্রিপরিষদ বিভাগে 'নির্বাচন কমিশন সচিবালয় (সংশোধনী) অধ্যাদেশ-২০২৫'-এর খসড়া পাঠিয়েছে নির্বাচন কমিশন। সেখানে নির্বাচন কমিশন সচিবালয়কে স্বতন্ত্রভাবে পরিচালনার জন্য একটি পৃথক 'নির্বাচন কমিশন সার্ভিস' গঠনের প্রস্তাব দেওয়া হয়েছে।
প্রস্তাবটি নির্বাচন ব্যবস্থা সংস্কার কমিশনের সুপারিশের সঙ্গে সঙ্গতিপূর্ণ ছিল।