মূলত এবং মুখ্যত নব্বইয়ের দশকেই বাংলাদেশে রাজস্ব আহরণে ঊর্ধ্বমুখী অগ্রযাত্রা শুরু। ১৯৯১-এর শুরুতে প্রথম তত্ত্বাবধায়ক সরকারের ব্যবস্থাপনায় পরিচালিত সাধারণ নির্বাচনের মাধ্যমে বাংলাদেশে গণতান্ত্রিক সরকার ক্ষমতায় আসে। বাংলাদেশে ট্রেডিং নির্ভরতা থেকে উৎপাদনমুখী অর্থনীতির নবযাত্রা শুরু হয় সেখান থেকেই। প্রথম বছরেই মূল্য সংযোজন কর আইন পাস ও প্রবর্তিত হয়। বিরানব্বই সালে জাতীয় রাজস্ব বোর্ডের লোকবল ও কর্মকাঠামোয় প্রথম সম্প্রসারণ ও সংস্কার নিয়ে আসা হয়। সে সময় বাংলাদেশে ব্যবসা-বাণিজ্য উৎপাদন ব্যবস্থায় নতুন উদ্যম, নতুন উদ্যোগ সংযোজিত হওয়ায় অর্থনৈতিক খাতের ব্যাপক প্রসার ঘটে, এ দশকেই তিনবার (১৯৯২, ১৯৯৬ ও ১৯৯৯) ঘোষিত হয় সংশোধিত শিল্পনীতি। ১৯৯৩ সালে সিকিউরিটিজ অ্যান্ড এক্সচেঞ্জ কমিশন গঠন, প্রাইভেটাইজেশন বোর্ড প্রতিষ্ঠা, সাউথ এশিয়ান প্রিফারেনসিয়াল ট্রেড অ্যারেঞ্জমেন্ট (সাফটা) চুক্তি স্বাক্ষরিত এবং ফাইন্যান্সিয়াল ইনস্টিটিউশন অ্যাক্ট পাস হয়। ১৯৯৪ সালে প্রথম সেলুলার ফোন পদ্ধতি চালু, ১৯১৩ সালের কোম্পানি আইন প্রথম সংশোধন, টাকাকে চলতি হিসেবে লেনদেনের জন্য রূপান্তরযোগ্য ঘোষণা, বাংলাদেশের আন্তর্জাতিক  অর্থ-তহবিলের ৮নং আর্টিকেলের মর্যাদা লাভ এবং আর্থিক প্রতিষ্ঠানগুলো আইন ও বিধিমালা জারি হয়। ১৯৯৫ সালে ইন্টারন্যাশনাল চেম্বার অব কমার্স অ্যান্ড ইন্ডাস্ট্রি ইন বাংলাদেশ (আইসিসিবি) গঠিত হয় এবং চট্টগ্রাম স্টক এক্সচেঞ্জ চালু হয়। ১৯৯৬ সালে হয় বিদ্যুৎ মন্ত্রণালয়ে পাওয়ার সেল গঠন, গ্রাসাধার বিধিমালা জারি, বিশ বাণিজ্য সংস্থা প্রতিষ্ঠা, প্রাইভেট এক্সপোর্ট প্রসেসিং জোন আইন পাস এবং প্রাইভেট পাওয়ার জেনারেশন পলিসি ঘোষণা।

দশকের প্রথমার্ধে ব্যবসা-বাণিজ্য-বিনিয়োগ-উৎপাদন তথা আর্থিক খাতে যুগোপযোগী আইন প্রবর্তন, নীতিনিয়ম পদ্ধতিতে পরিবর্তন ও সংস্কার সাধিত হওয়ার ফলে রাজস্ব আহরণের উপায় উন্নতি দৃশ্যগ্রাহ্য হয়। ‘মূসক’ আইন প্রবর্তনসহ বেশ কয়েকটি রেগুলটরি সংস্থা প্রতিষ্ঠার ফলে কর রাজস্ব আহরণের  প্রকৃতি বিস্তাত হয়  ও সার্বিক রাজস্ব আহরণের পরিমাণ বৃদ্ধি পায়। ১৯৮৭-৮৮ সালে জিডিপি ৫৯৭ বিলিয়ন থেকে ১৯৯২-৯৩ সালে ১২৫৪ এবং ১৯৯৭-৯৮ সালে ২০০২ বিলিয়ন টাকায় উন্নীত হয় সেই দশকেই। ভোগ জিডিপির অনুপাত ১৯৮৭-৮৮ সালে সেখানে ছিল ৯৭%, ১৯৯২-৯৩ সালে তা ৮৭.৭% এবং ১৯৯৭-৯৮ সালে ৮২.৬%-এ নেমে আসে। বিশেষভাবে  লক্ষণীয়,  জাতীয় সঞ্চয় ও জিডিপির অনুপাত ১৯৮৭-৮৮ সালে ১০.৭ থেকে ১৯৯২-৯৩ সালে ১৮.০ এবং ১৯৯৭-৯৮ সালে ২১.৮-এ উন্নীত হয় এবং মোট বিনিয়োগ জিডিপির অনুপাত ১৯৮৭-৮৮ সালে ১১.৮ থেকে ১৯৯২-৯৩ সালে ১৭.৯ এবং ১৯৯৭-৯৮সালে ২১.৬-এ উন্নীত হয়। এর প্রভাব প্রতিফলন ঘটে রাজস্ব আহরণ পরিস্থিতিতে ১৯৮৭-৮৮ সালে এনবিআর অর্জিত রাজস্ব আয়ের পরিমাণ, যেখানে ছিল ৩৯.৫ বিলিয়ন টাকা, ১৯৯২-৯৩ সালে তা  ৮৬.৪ এবং ১৯৯৭-৯৮ সালে ১৩৮ বিলিয়ন টাকায় বৃদ্ধি পায়। কর রাজস্ব আয় ও জিডিপির অনুপাত ১৯৮৭-৮৮ সালের ৮.৭% থেকে ১৯৯২-৯৮ সালে ৮.৮% এবং ১৯৯৭-৯৮ সালে তা ৯.৪%-এ উন্নীত হয়। এরপর অবশ্য কর জিডিপি ও অনুপাত আর তেমন বাড়েনি। মূলত কাছাকাছি থাকে। এর অর্থ হলো, অর্থনীতিতে আয়-ব্যয় বৃদ্ধি পেলেও, কর রাজস্ব আয় সমানুপাতিক হারে বাড়েনি। নব্বই দশক থেকেই বাংলাদেশের আমদানি-রপ্তানি বাণিজ্য ব্যাপকভাবে বৃদ্ধি পেতে থাকে। ১৯৮৭-৮৮ সালে আমদানির পরিমাণ ছিল ২৯৮৬ মি: মা: ড:, ১৯৯২-৯৩ সালে তা ৩৯৮৬ মি:মা:ড: এবং ১৯৯৭-৯৮ সালে ৭৫৪৫ মি:মা:ড-এ পৌঁছায়। অপরদিকে যে রপ্তানি ১৯৯৭-৯৮ সালে ১২৩১ মি:মা:ড, ১৯৯২-৯৩ সালে তা প্রায় দ্বিগুণ ২৩৮৩ মি:মা:ড: এবং ১৯৯৭-৯৮ সালে রেকর্ড  ৫১৬১ মি:মা:ড-এ দাঁড়ায়। আমদানি-রপ্তানি বাণিজ্যের অতি প্রাগ্রসরমান এ তথ্য-উপাত্ত পরিসংখ্যান নির্দেশ করে একটি দ্রুত গতিশীল অর্থনীতির এবং সেই সঙ্গে বৃদ্ধি পায় আমদানি শুল্ক, আয়কর এবং মূল্য সংযোজন কর আহরণের ক্ষেত্র বিস্তৃতির অবকাশ। কিন্তু প্রণিধানযোগ্য যে এ দশকে আমদানি-রপ্তানি শুল্ক ও মূশক তথা কাস্টমস বিভাগে রাজস্ব আয় বৃদ্ধি পেলেও আয়কর বিভাগের আয়ে অগ্রগতি সমানুপাতে আসেনি।

১৯৯১ সালে মূল্য সংযোজন কর আইন পাস এবং প্রবর্তন বাংলাদেশের রাজস্ব আহরণ ইতিহাসে একটি নতুন মাইলফলক, অবশ্যই একটি ইতিবাচক এবং দূরদর্শী পদক্ষেপ। বাংলাদেশে ভ্যাট আইন প্রবর্তনের প্রাক্কালে তৎকালীন আর্থ-সামাজিক রাজনৈতিক পরিবেশে যে আন্দোলন আলোড়ন সৃষ্টি হয়েছিল, বাংলাদেশে অনুরূপ অন্য কোনো আইন প্রবর্তনের সময় এত সমালোচনা ও বিরোধিতা অতীতে হয়নি।  বিরোধিতার প্রবল আন্দোলনের মুখেও মূসক আইনটি পাস ও প্রবর্তনে দৃঢ়তা প্রদর্শন এবং দূরদর্শিতার পরিচয় দেয় সরকার। প্রকৃত প্রস্তাবে আবহমান কাল থেকে চলে আসা ১৯৩০  সালের সেল অব গুডস অ্যাক্ট বা বিক্রয় কর ব্যবস্থাপনা এবং ১৯৬৯ সালের কাস্টমস অ্যাক্টের সংশ্লিষ্ট ও প্রযোজ্য কিছু ধারা-উপধারার প্রতিস্থাপন হিসেবে মূল্য সংযোজন কর (অধুনা বিশে^ অনেক দেশে যা জিএসটি হিসেবেও চালু আছে) প্রবর্তনের অনিবার্যতা অনস্বীকার্য হয়ে উঠেছিল। যদিও এ আইনের প্রতি দেশের  ব্যবসা-বাণিজ্য পরিবেশ ইতিবাচকভাবে সাড়া দিতে প্রস্তুত ছিল না। যথারীতি বিশ্বব্যাংক এবং আইএমএফের পরামর্শ ও দেশি-বিদেশি বিশেষজ্ঞ ও গবেষণা টিমের মাধ্যমে পরিচালিত সমীক্ষার মাধ্যমে ভ্যাট আইন প্রণয়নের উদ্যোগ থাকলেও বাংলাদেশের অর্থনীতি তৎকালীন প্রেক্ষাপট পুরোপুরি ছিল অন্যরকম অধ্যায়ে। ফলে ভ্যাট আইন  অনুধাবন এবং স্টেকহোল্ডারদের সঙ্গে আলাপ-আলোচনা পর্যালোচনার সুযোগ হয়তো তেমনভাবে নেওয়া হয়নি বা নেওয়া যায়নি এবং একই সমতলে অর্থনৈতিক অগ্রগতি দ্রুত বেগবান হওয়ার সঙ্গে উদ্ধৃত পরিস্থিতি ধারণ ও ব্যাখ্যার সুযোগ নতুন আইনে ততটা ছিল না।