প্রতিষ্ঠার কয়েক বছর পরও একটি ভাড়া বাড়িতে চলছে চাঁদপুর বিজ্ঞান ও প্রযুক্তি বিশ্ববিদ্যালয়ের শিক্ষা কার্যক্রম। চারতলা বাড়িটিতে নেই মানসম্মত শিক্ষার পরিবেশ, আধুনিক ল্যাব বা সমৃদ্ধ লাইব্রেরি।
যেখানে স্থায়ী ক্যাম্পাসই নেই সেখানে শিক্ষার্থীরা নিজেদের আবাসনের দাবি তোলারও সুযোগ পাচ্ছেন না। তাই বিভিন্ন বাসাবাড়িতে মেস ভাড়া করে দুর্বিষহ সময় পার করছেন তারা।
শিক্ষার্থীদের অভিযোগ, তাদের এ দুর্দশার জন্য দায়ী তৎকালীন শিক্ষামন্ত্রী দীপু মনি, তার ভাই আওয়ামী লীগ নেতা ডা. জে আর ওয়াদুদ টিপু এবং তাদের দোসররা। জমি নিয়ে তাদের দুর্নীতির কারণেই বাতিল হয়েছে বিশ্ববিদ্যালয়ের ভূমি অধিগ্রহণ।
