বাতজ্বর থেকে হতে পারে দীর্ঘমেয়াদি হার্টের সমস্যা, যদি সঠিক সময়ে চিকিৎসা না করা হয় তাহলে দীর্ঘমেয়াদি হার্টের সমস্যা হতে পারে। অনেকের আবার হার্টের ভালভ ক্ষতিগ্রস্ত হয়। এ সমস্যার মধ্যে ভালভ সরু হয়ে যায়। ভালভের কার্যকারিতা নষ্ট হয়ে যায়, সঠিকভাবে ভালভ বন্ধ হয় না। একেই বলা হয় বাতজ্বরজনিত হৃদরোগ।

এ কারণে রোগীর শ্বাসকষ্ট, বুক ধড়ফড়, কাশি অথবা কাশির সঙ্গে রক্ত ও পানি জমার কারণে ফুলে যেতে পারে পা। রোগীর কর্মক্ষমতা কমে যেতে পারে, এতে অল্পতেই হাঁপিয়ে ওঠে রোগী। অনেক সময় হৃৎস্পন্দন অনিয়মিত হয়। হার্টের ভেতর রক্ত জমাট বেঁধে যেতে পারে। অনিয়মিত হৃৎস্পন্দনের কারণে হার্টের ভেতরের জমাটবাঁধা রক্ত মস্তিষ্কে পৌঁছে স্ট্রোক পর্যন্ত হতে পারে।