ড. মুহাম্মদ ইউনূস নেতৃত্বাধীন অন্তর্বর্তী সরকার দায়িত্ব নেওয়ার পর থেকেই প্রশাসনে চলছে সংস্কার। গুরুত্বপূর্ণ পদগুলোতে চলছে রদবদল। চাকরি থেকে অব্যাহতি দেওয়া হয়েছে অনেককে। কেউ কেউ হচ্ছেন বিশেষ ভারপ্রাপ্ত কর্মকর্তা (ওএসডি)। একই সঙ্গে বিগত সরকারের সময়ে বঞ্চিত কর্মকর্তাদের পদোন্নতি ও গুরুত্বপূর্ণ জায়গায় পদায়ন করা হচ্ছে।

এসব কাজ করতে গিয়ে নানা আলোচনার জন্ম দিয়েছে অন্তর্বর্তী সরকার। সিদ্ধান্ত গ্রহণের মারপ্যাঁচে পড়ে অনেক যোগ্য ও বঞ্চিত কর্মকর্তা পদোন্নতি, গুরুত্বপূর্ণ পদে পদায়ন পাননি বলে অভিযোগ তুলে প্রতিবাদও করেছেন। কর্মকর্তারা নজিরবিহীনভাবে জানিয়েছেন তাদের ক্ষোভ। এটি প্রশাসনে বিশৃঙ্খলার জন্ম দেয়। যদিও পরে সিদ্ধান্ত সংশোধনের চেষ্টাও ছিল সংশ্লিষ্ট দপ্তরগুলোর।