মুহিবুল্লাহ হত্যা রহস্য জটিল হচ্ছে। বিভিন্ন এজেন্সির দায়িত্বশীল কর্মকর্তা ও তদন্ত কর্মে নিয়োজিতদের ধারণা, মুহিবুল্লাহ হত্যার সঙ্গে জড়িয়ে আছে আন্তর্জাতিক ষড়যন্ত্রকারী, যাদের স্বার্থ হানি ঘটছিলো রোহিঙ্গা প্রত্যাবর্তন প্রশ্নে, তারাই এই উচ্চকণ্ঠ মানবতাবাদী এবং মানবাধিকারকর্মী মুহিবুল্লাহকে হত্যা করেছে।
সহজেই আমরা এটা বুঝতে পারি যে মুহিবুল্লাহ চেষ্টা করছিলেন ১১ লাখ রোহিঙ্গাকে দেশে ফিরিয়ে নিয়ে যাওয়ার। তিনি আন্তর্জাতিক মানবাধিকার সংস্থাগুলোকে রাজি করবার কাজে নিয়োজিত ছিলেন। বেশ কয়েকটি সংস্থা, জাতিসংঘসহ বেশ কয়েকটি দেশের রাজনৈতিক নেতা ও রাষ্ট্রনায়ক মুহিবুল্লাহর যুক্তিগুলো অনুধাবন করতে পারছিলেন এবং তারা তাকে সাহায্য করতে সম্মত হয়েছিলেন। এই কারণেই কি তাকে হত্যা করা হয়েছে? নাকি আরো কিছু কারণ আছে? কারা আছে মুহিবুল্লাহ হত্যায় জড়িত? এ-প্রশ্ন দেশের সর্বত্র।