প্রধানমন্ত্রী ও মুখ্যমন্ত্রীর বিরোধের জেরে বিপাকে পড়েছিলেন পশ্চিমবঙ্গের মুখ্যসচিব আলাপন বন্দ্যোপাধ্যায়। তাকে সোমবার সকাল দশটায় দিল্লিতে এসে দায়িত্ব নিতে বলা হয়েছিল।  কিন্তু মমতা তাকে ছাড়েননি। আলাপনও দিল্লি যাননি। তখন তাকে মঙ্গলবার দিল্লি এসে দায়িত্ব নেয়ার নির্দেশ দিয়েছিল মোদী সরকার।

কিন্তু আলাপন ততক্ষণে অবসর নেয়ার সিদ্ধান্তের কথা জানিয়ে দিয়েছেন। মুখ্যমন্ত্রী মমতা বন্দ্যোপাধ্যায় জানিয়েছেন, আগামী তিন বছর আলাপন তার প্রধান উপদেষ্টা হিসাবে কাজ করবেন। নতুন মুখ্যসচিব হয়েছেন হরিকৃষ্ণ দ্বিবেদী।