দীর্ঘদিন ধরেই গাজীপুর বিএনপি দুই ধারায় বিভক্ত হয়ে আছে। দলীয় কোন্দলে দলটির নেতাকর্মীরা কেন্দ্রীয় কর্মসূচিসহ সব ধরনের কর্মকাণ্ডে নিজেদের গুটিয়ে রেখেছেন। সাবেক প্রতিমন্ত্রী ও সিটি কর্পোরেশনের প্রথম মেয়র অধ্যাপক এমএ মান্নান দীর্ঘদিন ধরে অসুস্থ রয়েছেন। তিনি বর্তমানে দলীয় কর্মকাণ্ডে অংশগ্রহণ করলেও তার অনুসারীরা মহানগর বিএনপির সভাপতি হাসান উদ্দিন সরকারকে বিরোধীতা করে দলীয় কর্মকাণ্ড চালাচ্ছেন। মান্নান অনুসারী হাসান সরকারের চাচাতো ভাই শ্রমিক দলের কেন্দ্রীয় কমিটির কার্যকরি সভাপতি সালাউদ্দিন সরকারের নেতৃত্বে মহানগর বিএনপির বড় একটি অংশ দলীয় কাজ করছেন। এতে দলীয় কোন্দল এখন প্রকাশ্যে রূপ নিয়েছে। এর ফলে দলের ভাবমূর্তি নষ্ট ও সংগঠন অবকাঠামো দুর্বল হয়ে পড়েছে। এসব কিছু প্রকাশ্যে এসেছে দলটির অসহায় কর্মহীন মানুষের পাশে না দাঁড়ানো এবং দলীয় প্রতিষ্ঠাতার মৃত্যুবার্ষিকী পালনকে ঘিরে।