ঝুলে থাকা দুই শতাধিক মামলা এবং কারাবন্দী নেতা-কর্মীদের মুক্তি না পাওয়ার বিষয়টি চিন্তার কারণ হয়ে উঠেছে হেফাজতে ইসলামের নেতাদের কাছে। কওমি মাদ্রাসাভিত্তিক এই সংগঠনের নেতা-কর্মী ও সমর্থকদের বিরুদ্ধে ২৮৫টি মামলা তদন্ত বা বিচারপ্রক্রিয়ায় রয়েছে। এ ছাড়া এখনো ৭ জন আলোচিত আলেমসহ অন্তত ১৯ জন কারাবন্দী আছেন।
হেফাজতে ইসলাম বাংলাদেশের দায়িত্বশীল নেতারা জানিয়েছেন, তাঁরা সরকারপ্রধানসহ স্বরাষ্ট্রমন্ত্রীর সঙ্গে একাধিকবার দেখা করে দায়ের করা সব মামলা প্রত্যাহার এবং কারাবন্দী নেতা-কর্মীদের মুক্তির দাবি জানিয়েছেন। সর্বশেষ গত ১৭ ডিসেম্বর গণভবনে প্রধানমন্ত্রী শেখ হাসিনার সঙ্গে এবং চলতি মাসের ১৬ জানুয়ারি সচিবালয়ে স্বরাষ্ট্রমন্ত্রী আসাদুজ্জামান খানের সঙ্গে বৈঠকেও এ দাবি করেছেন।