উপজেলা পরিষদ আইনে সুস্পষ্ট করে উল্লেখ আছে, স্থানীয় পর্যায়ে ১৭টি বিভাগ উপজেলা পরিষদের কাছে ন্যস্ত। কিন্তু এর ব্যত্যয় ঘটায় উপজেলা নির্বাহী কর্মকর্তাদের সঙ্গে উপজেলা চেয়ারম্যানদের ক্ষমতার বিরোধ বেড়েছে। সংশ্নিষ্ট মন্ত্রণালয়ের বিভাগের সচিবরা এসব দপ্তরের কাজ বাস্তবায়নে উপজেলা চেয়ারম্যানকে উপদেষ্টা ও উপজেলা নির্বাহী কর্মকর্তাদের সভাপতি করে পরিপত্র জারি করায় এ দুই পদে দায়িত্বশীলদের মধ্যে দূরত্ব আরও বেড়েছে। এই পরিপত্র অনুযায়ী উপজেলা নির্বাহী কর্মকর্তারা স্থানীয় পর্যায়ে প্রায় সব কাজে দায়িত্ব পালন করছেন।

উপজেলা চেয়ারম্যানরা উপদেষ্টা হওয়ায় উপজেলা পরিষদে কার্যত তারা কোনো ভূমিকা রাখতে পারছেন না। যে পরিপত্র জারি করা হয়েছে, তা উপজেলা পরিষদ আইনের সঙ্গে সাংঘর্ষিক। এর ফলে জটিলতা আরও সৃষ্টি হয়েছে। উপজেলা নির্বাহী কর্মকর্তারা উপজেলা পরিষদের বদলে উপজেলা প্রশাসন নাম উল্লেখ করছেন। এমতাবস্থায় উপজেলা পরিষদ আইনের যে বিধান, তা অকার্যকর হতে চলেছে।